地上世界
ノーチラス入手まで
地上世界を復活させるまで
- [難破船] : エリアを仲間にする
- [水の神殿] : クリスタルのかけらを入手
- [水の洞窟] : クラーケンを倒す → 水のクリスタルのジョブを入手＆アムルへ移動
- 難破船の宝箱を開けておく
- 水の洞窟をクリアすると地上世界は復活しますが、難破船へは二度と入れなくなります。難破船の2つの宝箱（ブラッドソード、ゼウスのいかり）を開けておくのを忘れずに。
エンタープライズの鎖を外すまで
- [アムル] : ジルと話す → 水路の扉が開く
- [下水道] : デリラばあさんから「ふゆうそうのくつ」を受け取る
- [ゴールドルの館] : ゴールドルを倒し、「クサリのカギ」を入手
- [ワールドマップ] : エンタープライズを調べて鎖を外す
- サロニアへ行く前に
- エンタープライズの鎖を外したら、次の目的地はサロニアですが、その前にダスターとレプリトへ寄っておきましょう。特にレプリトで「●ヒートラ」を4人分購入しておくと、サロニア城のガルーダ戦で有利になります。サロニア城へ近づくとエンタープライズが破壊され、しばらく他の場所へ行けなくなってしまうので注意。
ノーチラスを入手するまで
- [サロニア南西] : アルス王子を仲間にする
- [サロニア城] : ガルーダを倒し、ノーチラスを入手
- サロニアで竜騎士用の装備を入手
- サロニア南東にあるドラゴンの塔へ行けば、竜騎士用の装備品を多数入手できます。ガルーダ戦で竜騎士を使いたい場合は早めに攻略しておきましょう。また、アルス王子がパーティに加入してからガルーダを倒すまでの間ならば、サロニア南西の2人の老人からそれぞれ竜騎士用の装備品をもらえます。こちらは期間限定なのでお見逃しなく。
ノーチラス入手後
ノーチラスが海底へ潜れるようになるまで
- [ドーガの館] : ドーガを仲間にし、魔法陣の洞窟へ
- [魔法陣の洞窟] : 最深部まで進む → ノーチラスが海底へ潜れるようになる
- 海底ダンジョンを先に攻略しておく
- 魔法陣の洞窟をクリアしたら、次の目的地は時の神殿ですが、海底には他にも行ける場所があります。ドーガの村では多くの魔法をまとめて購入可能、海底洞窟とサロニアの地下迷宮では強力な装備品を入手可能です。時の神殿はモンスターが強力なので、まずは他の海底ダンジョンを探索するとよいでしょう。ただし、サロニアの地下迷宮のボス（オーディーン）から「グングニル」を盗みたいなら、シーフの熟練度が71以上になるまでは戦わないこと。
インビンシブルを入手するまで
- [時の神殿] : 「ノアのリュート」を入手
- [ウネのほこら] : ウネを仲間にする＆「ひのきば」を入手
- [古代遺跡] : 最深部からインビンシブルへ
- [インビンシブル] : 発進させる
- 山を越えて寄り道できる
- インビンシブル入手後は、地上世界ではファルガバード、浮遊大陸へ戻ればドールの湖とバハムートの洞窟へも行けるようになります。まずはファルガバードで魔剣士用の装備品を入手しましょう。ドールの湖とバハムートの洞窟はボスが強力なので注意。暗黒の洞窟やドーガの洞窟をクリアしてからの方が無難に戦えます。
ラストダンジョンまで
- [暗黒の洞窟] : ヘカトンケイルを倒し、「つちのきば」を入手
- [ドーガの洞窟] : ドーガとウネを倒し、「エウレカのカギ」「シルクスのカギ」を入手
- [古代の民の迷宮] : ティターンを倒し、土のクリスタルのジョブを入手
- [古代の民の迷宮] : 北側へ抜ける
- [クリスタルタワー] : 1F中央の部屋から禁断の地エウレカへ
- [禁断の地エウレカ] : 各種武器を入手
- [クリスタルタワー] : まおうザンデを倒す
- [闇の世界] : くらやみのくもを倒す → エンディング
- 土のクリスタルとエウレカは任意攻略？
- ストーリーを進めるだけなら上記チャートの3、5、6は省略可能ですが、通常ならば土のクリスタルのジョブを入手し、エウレカの武器も入手してからクリスタルタワーを攻略するのが無難です。縛りプレイやタイムアタックでもない限り、チャート省略はおすすめできません。
- 究極の武器を入手できる
- 禁断の地エウレカに踏み入れた時点で、モグネットイベントで「アルテマウェポン」を入手することができるようになります。終盤のボスと有利に戦いたいなら、いったん戻ってモグネットイベントを進めましょう。
- ラストダンジョンへ入る前に
- クリスタルタワー7Fの魔竜の鏡の前に立つと、それ以降は後戻りができず、ラスボスを倒すまで脱出もセーブも不可能になります（DS/スマホ版では中断セーブは可能）。クリスタルタワー6Fまで一通り攻略したら、いったん外へ出てセーブしておき、時間に余裕を持ってプレイできるように準備しましょう。
- クリア後のセーブを忘れずに
- 闇の世界でラスボスを倒すとエンディングとなります。スタッフロールの後にセーブする画面が表示されるので、セーブデータにクリアマークを付けたいならエンディングは最後まで見ること。クリアマークの付いたセーブデータで再開すると、古代の民の迷宮前からのスタートとなります。
- 隠しダンジョンもお見逃しなく
- ゲームをある程度までやり込むと、モグネットイベントで隠しダンジョンへ入れるようになります。ここにはラスボス以上の強敵が潜んでいるので、やり込みプレイヤーはぜひ挑戦しましょう。倒せば勲章アイテムを入手できます。